این کتاب، به عنوان یک راهنمای جامع، به بررسی عمیق و کاربردی شاخص‌های گزینش خطی در اصلاح نباتات می‌پردازد. در این اثر، ضمن تشریح مبانی نظری و ریاضی شاخص‌های مختلف، به نحوه کاربرد آن‌ها در شرایط گوناگون و با استفاده از داده‌های واقعی پرداخته شده است.

فصل 1- مقدمه کلی

چکیده

1-1- شاخص‌های گزینش خطی استاندارد

2-1- روش‌های شاخص گزینش ویژه

3-1- شاخص‌های گزینش خطی چندمرحله‌ای

4-1- شبیه‌سازی تصادفی چهار شاخص گزینش فنوتیپی خطی

5-1- RIndsel: شاخص‏های ‏گزینش با R

6-1- روش ضرایب لاگرانژ

منابع

فصل 2- تئوری شاخص گزینش خطی فنوتیپی

1-2- مبانی ایجاد شاخص گزینش فنوتیپی خطی

2-2- شایستگی ژنتیکی خالص و LPSI

3-2- پارامترهای اصلی LPSI

4-2- ویژگی‌های آماری LPSI

5-2- حالت‏های ‏خاص LPSI

6-2- معیارهای مقایسه کارایی LPSI

7-2- برآورد ماتریس‌های  G و  P

8-2- مثال‏های ‏عددی

9-2- LPSI و رابطه آن با شاخص گزینش فنوتیپی درجه دوم

منابع

فصل 3- شاخص‏های ‏گزینش فنوتیپی خطی محدودشده

1-3- شاخص گزینش فنوتیپی خطی دارای محدودیت نول

2-3- شاخص گزینش فنوتیپی خطی با بهره نسبی از پیش تعیین شده

3-3- شاخص گزینش فنوتیپی خطی با بهره مطلوب

4-3- قابلیت کاربرد  LPSI، RLPSI و PPG-LPSI

منابع

فصل 4- شاخص‏های ‏نشانگر خطی و گزینش کل ژنوم

1-4- شاخص گزینش نشانگر خطی

2-4- شاخص گزینش خطی کل ژنوم

3-4- برآورد پارامترهای LMSI

4-4- برآورد پارامترهای GW-LMSI در زمینه مجانب‌ها

5-4- مقایسه کارایی LMSI در برابر LPSI و GW-LMSI

منابع

فصل 5 - شاخص‏های ‏خطی گزینش ژنومی

1-5- شاخص خطی گزینش ژنومی

2-5- شاخص گزینش ژنومی خطی مرکب

منابع

فصل 6- شاخص‏های ‏گزینش ژنومی خطی محدودشده

چکیده

1-6- شاخص گزینش ژنومی خطی محدودشده (RLGSI)

2-6-  شاخص گزینش ژنومی خطی با بهره نسبی از پیش تعیین شده (PPG-LGSI)

3-6- شاخص گزینش ژنومی خطی محدودشده مرکب

4-6- شاخص گزینش ژنومی خطی با بهره نسبی از پیش تعیین شده مرکب

منابع

فصل 7 – روش‌های گزینش شاخص خطی فنوتیپی ویژه

1-7- روش شاخص گزینش ویژه فنوتیپی خطی

2-7- روش شاخص گزینش ویژه محدودشده فنوتیپی خطی

3-7- روش شاخص گزینش ویژه فنوتیپی خطی با بهره نسبی از پیش تعیین شده

منابع

فصل 8- روش‌های شاخص گزینش مولکولی و ویژه ژنومی

1-8- روش شاخص گزینش ویژه مولکولی

2-8- روش شاخص گزینش ویژه ژنومی خطی

3-8- روش شاخص گزینش ویژه خطی کل ژنوم

4-8- روش شاخص گزینش ویژه ژنومی خطی محدودشده

5-8- روش شاخص گزینش ویژه ژنومی خطی با بهره نسبی از پیش تعیین شده

منابع

فصل 9- شاخص‏های ‏گزینش خطی چندمرحله‌ای

چکیده

1-9- شاخص گزینش فنوتیپی خطی چندمرحله‌ای

2-9- شاخص گزینش فنوتیپی خطی محدودشده چندمرحله‌ای

3-9- شاخص گزینش فنوتیپی خطی با بهره نسبی از پیش تعیین شده چندمرحله‌ای

4-9- شاخص گزینش ژنومی خطی چندمرحله‌ای

5-9- شاخص گزینش ژنومی خطی محدودشده چندمرحله‌ای (MRLGSI)

6-9- شاخص گزینش ژنومی خطی با بهره نسبی از پیش تعیین شده چندمرحله‌ای

منابع

فصل 10- شبیه‌سازی تصادفی چهار شاخص گزینش فنوتیپی خطی

1-10- شبیه‌سازی تصادفی

4-1-10- استنباط‌ها

2-10- نتایج

منابع

فصل 11- RIndSel: شاخص¬های گزینش با R

1-11- پس‌زمینه

2-11- ملزومات، نصب و باز کردن

3-11- گام اول: قرائت داده‏ها

4-11- گام دوم: گرفتن پارامترها برای اجرا

5-11- شاخص گزینش

6-11- طرح آزمایشی

7-11- گزینش متغیر‌‌

8-11- متغیرهای پاسخ

9-11- شاخص‌های گزینش مولکولی

10-11- چگونه از RIndSel استفاده کنیم؟

11-11- خروجی RIndSel

منابع