پس از بازگشایی دانشگاه ها در سال 1361 نیاز به متون علمی برای رشته های مختلف دانشگاهی به شدت احساس می‌شد و به همین دلیل جهاد دانشگاهی به عنوان بازوی اجرایی ستاد انقلاب فرهنگی فعالیت های انتشاراتی را در دستور کار خود قرار داد. گستردگی فعالیت های این نهاد در زمینه تولید و نشر کتاب و ترویج فرهنگ کتاب و کتابخوانی در سال ۱۳۷۹ به تأسیس سازمان انتشارات جهاد دانشگاهی منجر شد. این سازمان طی این سال‌ها در دو زمینه تولید محتوای علمی مورد نیاز دانشجویان و اساتید و ترویج فرهنگ کتابخوانی و مطالعه در بین دانشجویان به موفقیت‌های چشمگیری دست یافته است. این سازمان در حال حاضر در 31 استان کشور فعالیت های انتشاراتی خود را از طریق واحدهای جهاد دانشگاهی دنبال می‌کند و شبکه گسترده ای از فعالیت ها را در زمینه‌های تولید محتوا و چاپ، توزیع و فروش و فرهنگ‌سازی در زمینه کتاب و کتابخوانی ایجاد کرده است. مجموعه انتشارات جهاد دانشگاهی امروزه بخش قابل توجهی از متون علمی مورد نیاز دانشگاهیان در سراسر کشور را در تمامی زمینه‌های علمی تامین می‌کند و چاپ بیش از 11 هزار عنوان کتاب از ابتدا تاکنون نشان از این امر مهم دارد. تولید و نشر منابع علمی دوره های آموزشی تخصصی جهاد دانشگاهی در سراسر کشور از دیگر فعالیت های این مجموعه است. 

  این سازمان در زمینه فعالیت های ترویجی نیز اقدامات منحصر به فرد و برنامه‌های متنوع و ماندگاری را در دانشگاه‌های کشور اجرا می نماید که از آن جمله می‌توان به جشنواره ملی کتاب سال دانشجویی، جشنواره ملی پایان نامه سال دانشجویی، مسابقات ملی پایان نامه سه دقیقه ای، جشنواره ملی کتاب سه دقیقه ای، کنفرانس بین المللی پژوهش های نشر و ... اشاره  کرد. تجلیل از استادان فعالان و مربیان عرصه کتاب و مطالعه، سلسله نشست‌های نقد و بررسی کتاب های دانشگاهی و تولید محتوای دیجیتال و نشر الکترونیک از دیگر اقدامات مهم این مجموعه به شمار می رود. این مجموعه در حال حاضر سازمانی مرجع و مورد اعتماد برای دانشگاهیان و فرهیختگان در زمینه کتاب و کتابخوانی و نشر به شمار می‌رود .